Для профілактики хвороб розсаду томатів її обробляють біопрепаратами Фітоцид, планриз кожні 7-10 діб.
Крім цього, з фази двох справжніх листків рослини можна обробляти Превикуром 607 SL (2-4 л 0,15% розчину на 1 кв. М площі) 1-2 рази на місяць. Цей препарат можна додавати в живильний розчин.
У фазі п’яти справжніх листків розсаду поливають розчином Конфідор Максі, додаючи його також в живильний розчин (15 мл на 10 л води). Така обробка захистить рослини від сисних шкідників протягом наступних 45-50 діб.
За 3-5 днів до висадки розсади у відкритий грунт для профілактики грибкової інфекції розсаду обробляють препаратом РідомілГолд МЦ 68 WG, 15-20 г-на 10 л води з додаванням карбаміду 20-25 г-на 10 л води.